5 Desa utama

*
Konohagakure

Letak : Hi no kuni
Pemimpin : Hokage

* 

Sunagakure
Letak : Kaze no kuni
Pemimpin : Kazekage

* 

Kirigakure
Letak : Mizu no kuni
Pemimpin : Mizukage

* 

Iwagakure
Letak : Tsuchi no kuni
Pemimpin : Tsuchikage

* 

Kumogakure
Letak : Kaminari no Kuni
Pemimpin : Raikage

Desa ninja kecil di Manga & Anime

*
Amegakure
Letak : Ame no kuni
Pemimpin : Konan

*
Otogakure
Letak : Ta no kuni
Pemimpin : Orochimaru

*
Hoshigakure
Letak : Kuma no Kuni
Pemimpin : Hoshikage

*
 Tonbogakure / Kagerou Village
Letak : Yama no Kuni
Pemimpin : ???

* 
Takigakure
Letak : Taki no Kuni
Pemimpin : Shibuki

*
Kusagakure
Letak : Kusa no Kuni
Pemimpin : ??

*
Yugakure
Letak : ?? no Kuni
Pemimpin : ??

Desa Ninja yang belum di ketahui tempatnya

* 

Takumi

* 

Moyagakure

* 

Uzugakure

* 

Getsugakure

* 

Desa tidak diketahui

* 

Tanigakure

Desa Ninja yang di tunjukkan pada The Movie

* 

Sora no Sato

* 

Yukigakure